Kerja Sama Lembaga Pendidikan Internasional

UAJY selama ini telah memperluas jaringan kerjasama dengan berbagai institusi pendidikan maupun bisnis, dari dalam maupun luar negeri.
Untuk instansi dari luar negeri, saat ini UAJY menjalin kerjasama dengan :

Asian Institute of Technology, Thailand
ACECOMS (Asian Center for Engineering Computations and Software) - AIT, Thailand
Edith Cowan University, Australia
Notre Dame University, Fremantle - Australia
Princenton in Asia
NIIT - India
Ilmenau Technical University, Germany
Saint Louis University, Baguio City, Filipina
Women’s University, Mumbai India
dll
Kerjasama tersebut antara lain diarahkan untuk perolehan beasiswa bagi dosen yang berminat untuk studi lanjut dan pengembangan program studi - program studi yang relevan, sedangkan dengan ACECOMS (Asian Center for Engineering Computations and Software) - AIT, Thailand, UAJY menjadi satelite centre.
Dengan instansi dalam negeri, telah terjalin pula beberapa kerjasama, antara lain dengan pemerintah daerah, himpunan ahli, Perguruan Tinggi, Media, Lembaga Pemerintah maupun swasta, dll

UAJY juga aktif dalam berbagai asosiasi perguruan tinggi, antara lain menjadi anggota:

APTIK (Asosiasi Perguruan Tinggi Katolik) di Indonesia
ASEACCU (Association of South East and East Asian Catholic Colleges and Universities)
IFCU (International Federation of Catholic Universities)